“TOKYO MER”正式认可半年。为了在全国政令指定城市开展MER，代替离开队伍的音羽（贺来贤人）的第二医生问题让喜多见（铃木亮平）头痛不已。在队伍内希望比奈（中条绫美）升格的声音也提高，不过，音羽断言比奈应该向循环器外科的道前进。比奈也感到压力，烦恼着能不能代替音羽。这时，青户（伊藤淳史）作为支援医生来到MER。青户和音羽一样是厚生劳动省的医科技术官，表面上是作为第二医生候补的派遣，但那里有厚生劳动省方面的想法。
　　就在这时，隅田川发生了大型水上巴士和屋形船的碰撞事故。载着很多伤员，失去控制的屋形船暴走了。虽然是赶往现场的MER的成员们，但是因为不能接舷，所以不能进入。并且由于船底内部的燃料泄漏，装载了很多的患者爆炸的可能性被发现！喜多见等人为了救助被遗弃的人们，进行了意料之外的作战。那正是决死的挑战。

　　裏稼業で働く孤独なヤクザの辰巳は、ある日元恋人・京子の殺害現場に遭遇する。 一緒にいた京子の妹・葵とともに命からがら逃げる辰巳だったが、最愛の家族を失い、復讐を誓う葵は京子殺害の犯人を追う。 葵に振り回されながらも彼女を助ける辰巳は事件の真相に迫っていくのだが...

故事发生在东京八丈岛近海，一座将全球各地警方监控相连接的高科技设施——“太平洋浮标”即将启动。为了与欧洲刑警组织管辖的范围联网，来自世界各地的工程师聚集在这里。基于人脸识别的全新“黑科技”也正在测试中……与此同时，柯南一行人前往八丈岛观鲸，途中柯南接到冲矢昴（赤井秀一）的电话，被告知欧洲刑警组织成员在德国遭到琴酒的杀害。为调查真相的柯南潜入“太平洋浮标”。正当工程师们正在为系统启动而展开准备工作时，一桩案件突然发生！一名女工程师被黑暗组织绑架，她手中存有核心技术的U盘也落入了黑暗组织手中！此时，水下传来未知潜水艇逼近的声音，令人毛骨悚然，一个神秘的黑影也正在悄悄接近灰原哀……

本作は、山道での交通事故で両親と弟を失う悪夢を見た縁（えん）を主人公に据えたサイコスリラー。不吉な予感に襲われた彼女は、数日後に予定していた避暑地の山に向かう家族旅行をやめるよう父親に説得を試みるが、聞く耳を持ってもらえない。そんな中、縁は同じマンションの住人から、夢で見た交通事故はすでに起こった出来事だと告げられる。