立藤美学园，仅仅因为一个入侵者——“它们”，而化作了地狱的坩埚！“它们”袭击人，咬人，产生出新的“它们”席卷了整个学园。在化成恶魔的世界的学园内，小室孝和青梅竹马宫本丽、朋友井豪永，暂时去避难。但是，为了保护丽而被“它们”咬的永却变成了“它们”……剩下来的两人，与其他幸存者，同级同学高城沙耶、平野户田、剑道部主将毒岛冴子、校医鞠川静香汇合，下定决心逃出学园！他们有办法活下来吗！？
完美的我为什么…会对什么老土男兴奋啊…！？放荡自恋男×脱下衣服很煽情的邋遢男，倔强的 BL 开幕！──梶虽然表面工夫既好又是人气王，私底下却会帮他人打分数、看不起别人。他不断追求理想，寻找有没有配得上自己的最佳完美 0 号。一日，他不得不和不起眼的同事・深见一起外宿出差。唯有这家伙，就算我们单独 2 人到了无人岛上，我也不可能会和他做──他原本是这么想的，但是刚洗完澡深见却可爱又…性感到，让他怀疑自己看错！？顺势被拥抱的身体别说是 0 分了，根本是 100 分满分…！
佐藤和真（和真饰）是一位热爱游戏的蛰居族， 原本因一场交通事故（！？）而生命戛然而止，结果却转生 到了异世界，与女神阿克娅为伴。 「像RPG游戏一样，在异世界享受梦寐以求的冒险家生活！以成为英雄为目标！」 但是，和真的转世生活在短时间内充满了麻烦。 他最终与三个能力极强但极其令人失望的 人组成了一个队伍： 阿克娅，一个无用的麻烦制造者的女神，惠惠，一个激怒中二病的魔法师，以及达克妮丝，一个不断 妄想的女骑士。债务、以颠覆国家罪受审、 讨伐魔王军首领，有时甚至死亡…… 有一天，和真等人从红魔村回来，收到了一封信。故事讲述的是，爱丽丝公主想听听和真一行人 打败魔王军首领的冒险故事。
阴云密布的本能町，在神秘恐怖的本能字学园，高高在上的学生会长鬼龙院皋月（柚木凉香 配音）只手遮天，她通过“极制服”统领校内的学生，极制服由所佩戴的星星数量分级，级别越高拥有的战斗力就越强。这一天，一个背着单片太刀剪的女孩出现在本能字学园门口。她叫缠流子（小清水亚美 配音 ），为了调查杀害父亲的真正凶手而来到这个凶险的所在。谁知她刚刚到来不久，便遭到蟇郡苛（稻田彻 配音）、猿投山渦（桧山修之 配音）等学生会四天王的阻击。 关键时刻，缠流子意外得到父亲制作的黑色神衣，由此战斗力大增。连番激烈的战斗在本能字学园展开……
顺利升入高中的少年富樫勇太（福山润 配音）在初中时代曾是暗黑系的中二病患者，当年他自称黑炎之主人，自我感觉良好地度过了无厘头的中学生活。但是此刻他“痛改前非”，将这段经历看作不堪回首的耻辱过去，为此甚至不惜报考一个离家很远没有人认识自己的高中。在新的学校，勇太如愿以偿结 交了一色诚（保志总一朗 配音）、丹生谷森夏（赤崎千夏 配音）以及学姐五月七日茴香（浅仓幸美 配音）这样稍显正常的朋友，也准备和心仪的女孩大谈一场浪漫恋爱。但是令他备为挠头的是，楼上新搬来的住户兼同班同学小鸟游六花（内田真礼 配音）却是一个中二病的深度患者。小女孩每天唧唧歪歪，怪力乱神。好不容易摆脱初中阴影的勇太，高中恋爱之梦日渐飘渺……
混沌的魔法时代，没有秩序和权威，只有血腥的杀戮。星罗棋布的小国散落在大地上，人类正处于未开化的蛮荒时代。但是传说在四百年前曾经有一个辉煌的旧世界文明，他们掌握着不同于元素魔法的旧世界魔法，但却在四百年前被一个叫安拉沙斯克斯的破坏神毁灭了。破坏神在七天之内，完全消灭了当时的文明世界，但是却没能毁灭人类。一个被称为“龙战士路西法”的救世主降临，击败了破坏神。在安拉沙斯克斯的身上施加了四个封印，使其意志与身体分离。龙战士离去时曾留下预言，说有一天当破坏神苏醒时，流着路西法血的人将成为新的龙战士，再次封印邪神。四百年过去了，人们在废墟上建立起新的文明，破坏神的身体沉睡在拥有最强兵力的王国久达斯王城下，其余的三个封印分别存放在另外三家古老的王国中。后来，出现了一个邪恶的魔法师达克·修那依达（DS），他拥有极大的魔力和可怕的野心，掌握着各种古代语魔术，能够同时操纵几千个魔操兵。迈卡里特王国第一王子拉兹率领十位勇士向这位魔人发起挑战。最后拉兹化身为了传说中的无敌机神龙战士打败了DS，世界恢复了和平。人们对外宣称杀死了魔人DS，但其实魔人的灵魂被封印在一个新生婴儿的体内。拉兹王子从此行踪不明，那个孩子也被十勇士之一的大神官秘密带回了迈卡里特王国抚养，一晃就是十五年。 当年在DS的身边聚集着四个人：强壮豪爽的忍者格拉，美丽的妖精雷帝阿杰斯·奈丽，被称做“冥界预言者”的黑暗僧侣阿比杰鲁以及银发的冰魔导师卡鲁斯。当中有的是DS的朋友，恋人，女儿或是学生，他们被称做“四天王”。以卡鲁斯为首，“四天王”在十五年间发展了一支庞大的军队，这支由各种亚人类和魔物组成的军队攻克了许多王国。而在阿比杰鲁的策动下，他们开始寻求让古代破坏神安拉沙斯克斯复活的方法，他们认为只有借助破坏神的力量才能创造出没有纷争的理想国，完成当初DS统一世界的梦想。 趁着大神官随骑士团远征的机会，魔术师奥斯堡带领亚人类打进了迈卡里特王城，两个孩子在慌乱的人群中辗转：一个是大神官十五岁的女儿洋子，另一个是从小与她一起长大的鲁吉。洋子想起父亲曾经说过在鲁吉的体内封印着一个邪恶的魔法使者，只有用纯洁的处女之吻才能解开这个封印。眼看城内已成一片火海，洋子顾不得许多，吻了鲁吉。鲁吉一下子长高，凶恶的魔人DS复活了！他很轻松的收拾了入侵的亚人类军团，狂妄地宣称要找大神官他们报仇，继续自己十五年前的事业。结果却在强吻洋子的时候重新被还原成鲁吉，原来封印的咒语也是处女之吻......
在人类的历史和传说中记载着许多妖魔鬼怪的故事，很少有人知道他们是真正存在的，而它们的本来面目竟然是一种植物生命体。日本传说中的荒神也是这种植物生命体。而传说中被从高天原流放的天照大神之弟须佐之男竟然是它们的首领。而传说中他从八歧大蛇口中所救的女孩奇稻田姬则是代代转生，专为封锁荒神而存在的巫女，一旦巫女不能够自然死亡，那么日本所有的荒神就都将在第一时间死亡，但巫女活着又会制约它们的力量。所以历代的奇稻田姬都会在当时政府的严密监护下生活，而荒神们几百年一成不变的矛盾就是又想杀死又不得不保护。 到了藤宫红叶这一代，问题发生了变化，继承奇稻田姬力量的是一对孪生姐妹红叶和枫，由于封印力量的减弱，荒神们又逐渐恢复了力量，而须佐之男竟然也开始慢慢复苏。荒神们制造了一个结界，准备在里面杀死红叶，以确保自身不受影响。但一个神秘的少年草雉，却打算在荒神动手之前抢先杀死红叶。原来草雉是荒神们培养的秘密武器，八歧大蛇把自己的荒神力注入人类孩子的体内，那就是草雉。他为了摆脱控制，决定抢先杀死红叶，以便令所有的荒神死亡。然而，渐渐地他却对红叶产生了另外的感情……
回过神后发现，我转生成为了游戏中年仅8岁的大公主，未来将继承王位。 身为与玩家对抗的最终BOSS，本将会给身边人带来不幸，走向灭亡…… ……是说，我根本早早去死比较好吧？ 但是，既然可以改变故事线，那我要充分运用“可以预知未来”的天赋，防止悲剧，拯救大家！ 这是反派最后头目女王在不知不觉间深受众人爱戴的故事。
故事发生在一块失落的大陆上。在这个大陆的居民由于失落大陆的影响，其中的一些人具备了能力，亦是他们所说的超能力者。 故事中两个原本对立的主人翁刘凤和一马，因为所秉持的观念不同，各自为不同的对象服务。只不过一个名正言顺的替政府办公，利用超能力战士来遏制原居民中的超能力者，使其不滋生事端。另一个却是被指责为反派的为原大陆居民寻求真正的自由、独立。 像一马所说的，自由要K自己的手来获得，那才叫真正的自由。别人给与的，别人同样也能拿会去。所以他不愿投K到刘凤那边。以至于两者间不停不休的战斗。 因为一起意外事件,刘凤失忆，沦落在失落的大陆。亲身感触到很多事情的他，觉得原来的观念是偏颇的， 于是便站在了原大陆居民一边。结果遭到原组织的追杀…… 了解了一切真相的刘凤，最后和一马成了并肩的战友，亦决定去打败真正造成这一切的罪魁祸首……
幼时曾深陷绝望深渊的直枝理树，与4位少年少女相遇了。 在那之后数年，理树作为Little Busters的一员，喧闹地过着快乐的每一天。 这样的时间能够一直持续就好了。理树所期望的只有这样。 某日，恭介突然表示要成立一支棒球队伍， 理树则开始了寻找成员的任务。 在这样的过程中，理树邂逅了新的成员们。 和大家一起参加试胆大会，潜入女生宿舍时被换上女装，一起演人偶剧……。 经历了许多快乐的事情， 同时也在大家的帮助下解决了各自拥有的烦恼。 最后在棒球比赛中，理树确认了和最好的朋友们之间的牵绊。 ——然而，这并不是结束。 和来谷唯湖之间的故事。 理树与铃的故事。 以及，理树和铃终于知晓的“世界的秘密”。 Little Busters真正的物语，自此开始——。
本动画的主人公是佐藤良太以及他的小伙伴们，故事围绕着五年级小学生看似纯真无邪又充满成人式幽默的日常生活展开。 良太是个元气十足的男孩子，他爱玩爱闹，最好的朋友是今井浩二和河合翼。在5年2班里，每天都热热闹闹，偷看A书，议论女生，好动而早熟的男孩子们遇上什么事都要大惊小怪 一番。与男孩们的好动不同，千佳、有纪这些女孩们显得更加早熟文静，常常对男孩们的幼稚举动感到无语，但在很多时候，女孩们也会在意男孩们的话题…… 热血少年、天然呆、眼镜娘、冰山脸，不同于普通的小学班级，5年2班里有着个性迥异的少男少女，他们上演了一出又一出让人心跳不已的好戏……
公元2307年，地球的化石燃料枯竭了。经过将近半个世纪的建设后，建成了全长5万千米、以3条轨道升降机为中心的太阳能发电系统。为了建造出这个能制造半永久能量的巨大建筑物，世界形成了3个巨大的国家联盟：以美国为中心的“世界经济联盟”，通称UNION；以中国、俄罗斯、印度为中心的“人类革新联盟”；新欧洲共同体AEU。由于轨道升降机过于巨大，防卫变成了十分困难的任务。但各国军队依然为了自己的威信与繁荣进行着大规模的zero-sum game（任何一方都得不到好处的竞争）。这样的世界，要为其花上句号的组织出现了——拥有机动战士高达的“天人”私人武装组织。他们为了消除世界的纷争，展开了超越民族、国家、宗教的作战行动。高达驾驶员刹那•F•清英决心改变这个世界。
東京奪還編、開戦。 謎の少年・スティグマ率いる“アマラリルク”との戦いを経て少し成長したシャイ。 日本に戻ってきた彼女が出会ったのは、忍者の里から家出中という少女・天王寺曖だった。 彼女は“アマラリルク”の一員を追って里を出てきたとシャイに告げる。 そんな中、東京が突如黒球に包まれて消失する事件が発生。ヒーローたちは東京を救出するため出動するーー。
