《太祖秘史》展现了一代天骄努尔哈赤大情大性的一生，讲述了努尔哈赤和他的女人们的故事。在那个血与火，情与爱的年代，努尔哈赤如一匹奔跑在辽东大地上的孤狼，面对杀父之仇，夺子之痛；众叛亲离，走投无路；终十三甲起兵，统一女真各部，与明朝分庭抗礼，缔造英雄霸业。东哥、佟佳氏、阿巴亥、孟古、那齐娅这五个如清泉一般的绝世美女，用温婉溶化了英雄的铁石心肠，用柔情成就了一代枭雄，但红颜薄命也带给了努尔哈赤此生无可挽回的遗憾，终使英雄郁郁而终………
唐贞观年间， 西凉 叛乱， 李世民 御驾亲征，被敌帅 苏宝同 围困在锁阳城， 主帅 ， 薛仁贵 也被 苏宝同 的毒刀所害，命在旦夕。 薛仁贵 之子 薛丁山 获知父亲遇难，参加了二路平乱大军，西去救父。 一路上， 薛丁山 收服山贼窦一虎、大战 苏宝同 ，最终将薛仁贵和 李世民 从 锁阳城 救出。 李世民 班师回朝，留下薛氏父子继续平乱。 苏宝同 搬来救兵并派出手下大将樊洪前去挑战。 樊洪之女 樊梨花 对 薛丁山 一见钟情，不惜和家人反目，献关投薛。 薛丁山 却听信谄言，误以为 樊梨花 是杀父害兄的不义之人，将 樊梨花 赶出唐营。后来在 程咬金 等人的撮合帮助下，上演了“三休三请 樊梨花 ”的动人故事。最终几经离合， 薛丁山 和 樊梨花 终于结为夫妻。在他们的共同努力下，唐军终于平定了 西凉 之乱。
相府嫡女苏云绮意外发现自己是“命书”中的炮灰女配，并被记录在“命书”当中无法改变。面对不公的命运，苏云绮选择反抗，她要利用“命书”逆天改命，寻求真实的自己，收获真挚的爱情！
心医叶平安（刘诗诗 饰）为一桩旧案寻至圣都，因擅用心计，被人视作“巫女”，人人避之不及。大理寺丞元少城（窦骁 饰）出身邙沟贱民区，他冷峻狠戾，时刻抓住机会向上爬。此时，圣都突发命案，一朝廷命官惨死家中。叶平安曾为其治疗失眠顽疾，且正好出现在命案现场，因此被视作杀人凶手。元少城看出此案蹊跷，但仍将叶平安置于死地，以作自己晋阶的“投名状”。可任谁也想不到，叶平安早已在她的复仇之路上，下出了布局的第一颗棋。
原本是富商沈家与军阀聂家联姻的喜日，大小姐沈青夏（牛欣欣饰）却陡然遇害、羞愤辞世；沈家丫鬟小蝶（柯颖饰）为报此仇假扮千金，嫁给聂氏少帅聂祯（文渊饰）。然而当小蝶发现加害者嫌疑直指聂祯时，等待着她的不是一个简简单单的复仇行动，更多的爱恨情仇开始交织。原本的恶人似乎有着善良的真实面，原本的故人却又蒙上了暴虐的黑面纱，在漩涡中升腾的故事，开始延宕出因果的终局，凝练出真爱的誓言
讲述了天才少年陈恭喜，斩获雀神后封牌归隐，三年后因两大集团在商会麻将比赛上的争夺，各路人马纷纷来请他出山……由此引发的一系列跌宕起伏、有笑有泪的故事。
讲述了乾国“畏寒”女捕快苏玖儿（李一桐 饰）与祺族“内热”少主寒狰（毕雯珺 饰）因关乎两族关系的离奇凶案相遇，机缘下组成“温差搭档”，携手穿破阴谋迷雾，寻找案件背后真相的同时化解家国危机的故事。
本剧集故事承接第一部剧情，讲述汉武帝刘彻（黄晓明饰）经过五年执政后进入他实施雄才大略阶段的故事。已坐稳皇帝宝座的刘彻，此时却触景生情，感慨当年亲如手足的兄弟们多已不在人世，唯一仍在人世的李勇（杜淳饰）却陷落匈奴手中，东方朔也一去不复返。 历经千难万险寻找李勇下落的秋蝉（刘芸饰），终于在匈奴找到他时却发现他已与匈奴公主成婚。汉武帝微服出游，邂逅长相酷似已逝的陈阿娇的歌伎李娃（何佳怡饰），不禁怜爱有加。不久李娃入宫成为刘彻的新宠。然而已为皇后的卫子夫（宁静饰）却预见陈阿娇的前车之鉴又要重演。汉武帝派汲黯（杨洪武饰）去寻访东方朔，无意间遇见了怀才不遇的狂士主父偃（王刚饰），认为是奇才，遂力荐主父偃入宫辅佐汉武帝。汉武帝听信谗言，将卫青（董勇饰）的兵权交给霍去病（李立饰）。
二三十年代的旧上海，笼罩在伪警察、黑社会、日本奸商、英国买办的恶势力下，老百姓愁云惨淡，敢怒不敢言。一群有志之士，立誓要与恶势力斗争，虽然手无寸铁，但他们凭借超凡的智谋和胆魄，设计一个又一个精彩绝伦的计谋，使坏人纷纷自投罗网、自相残杀、自食恶果。他们中有足智多谋、人称“骗侠”的韩飞；有善于化妆的司马佬；有弹弓神射手毛小奇；有精通机械工程的鬼马丁；有扮谁像谁的“一剪梅”；有“飞毛腿”小辫子……这些嫉恶如仇、身怀绝技的人们团结在一起，劫富济贫、支援抗日，用他们的血肉之躯谱写了一曲“乱世真情”。 在重重磨难中，韩飞赢得了大律师的女儿郑华的忠贞爱情；痴情的一剪梅挡住了射向韩飞的子弹；一心替父报仇的毛小奇，突然发现他的仇人竟然是自己最崇拜的“骗侠”……夫妻情、师徒情、父子情、朋友情是流淌在全剧中的又一片“乱世真情”。
姜甜离家去北京做一名室内设计师，一股劲地想攒钱买房，经营感情。当所有的一切都在往憧憬的方向发展时，姜甜却因得罪了公司领导而被调任到家乡的分公司，不得不与男友方元清分隔两地。分公司的职场环境与姜甜的想象相去甚远，她出人意料地与六十岁的吴敬芳成为同事。姜甜回京的计划因与男友分手而被打断，还为此丢了工作。失业失恋的姜甜无奈滞留家乡。吴敬芳带姜甜一步步走出颓丧的日子，为了学习设计，她成为了姜甜的助理。姜甜在吴敬芳的影响下找到个人发展及融入家乡的方式，吴敬芳也在姜甜的帮助下发现了自己全新的价值和可能性，重新融入竞争激烈的社会。两人在一次次的挫折中建立起深厚的战友情，在帮助别人建造理想中的家的同时，也坚定了各自未来要走的道路。
辽沈战役期间，解放军营长高大山（孙红雷 饰）率部救下农家女秋英（陈小艺 饰），后来秋英寻亲来到部队，与高结为夫妻。二十年后，高大山升任守备区司令，女儿高敏（孙杨 饰）参军，与一位排长相恋，被秋英棒打鸳鸯，最终高敏嫁给了高大山的老战友陈刚（李玉峰 饰）之子陈建国。强扭的瓜不甜，不久二人分手。儿子高权（邢佳栋 饰）自幼顽劣，高大山把他送到部队，后来因公殉职。次子高岭（高冰 饰）闻讯哥哥牺牲，毅然放弃了报考较舒适的文艺团体，走上了哥哥曾经战斗过的哨位。时势的变迁和家庭的变故让高大山夫妇感慨万千，随着守备区编制的撤消，高大山也解甲归田，他终于回到了魂牵梦绕的家乡......
同样自称千杯不醉的江路（董又霖 饰）让刘雅礼（林昕宜 饰）尝到了棋逢对手的滋味，更令她久违地当场“醉倒”，“宿醉”醒来，刘雅礼发誓要找到江路，却发现神秘男江路竟是刘雅礼素未谋面的新老板！“千杯不醉”的背后似乎也另有隐情……
张生白以追逐利益为先，而李成乾则追求诚信，张生白用诡计迫使李成乾离职。李成乾回乡途中遭遇车祸，被凤凰村村民赵富贵舍命相救。为了报恩，李成乾留在凤凰村教书育人，并抚养救命恩人之子赵出息。其间李成乾与徒弟简影秘密创办公司，将一生经验传给赵出息，并留下重要遗嘱。赵出息为改善家乡环境出来打工，在李成乾女儿李青衣的安排下与简影重逢，加入三江集团。在企业危机中，他稳住现金流，揭露幕后黑手，根据遗嘱成为董事长。凤凰村遭泥石流，赵出息挺身而出，却和张生白再次产生矛盾。李青衣公开事件真相，张生白悔不当初并承认了错误。凤凰村的重建工作如火如荼地展开。
