Muv-Luv ATE全名为《Muv-Luv Alternative Total eclipse 》，全集动画片改编自《Muv-Luv Alternative》的外传小说。故事的时间设定在西元2001年，由于人类遭到地球外起源种(联合国称其为BETA)的侵略，正面临灭亡的危机，因此人类开始了先进战术机技术开发计划“XFJ计划”，各个国家均派遣了专门人员参与其中，该作讲述的就是这些被派遣过来的人员之间的故事。 （有虫子吃掉妹纸情节,反差极大,请谨慎观看.）
与有点沉重的黑暗精灵异国风美女交织出一段甜蜜而沉重的逆异世界同居恋爱喜剧！ 转生至异世界，获得神力成为勇者的高中生春原日向，和以黑暗精灵玛莉亚贝尔为首的可靠伙伴们，一起成功讨伐魔王！在之后因为实现了神明的愿望，而顺利回归到原本的世界。在这之后过了1个月，只希望能与心爱的日向共结连理的玛莉亚贝尔从异世界前来现世！因为有一～～点点沉重的爱情和一小匙左右的嫉妒心，所以有事没事就会（在许多不同层面上）袭击日向的贝尔，在无可奈何之下展开的同居生活，可说是非常刺激又十分破天荒？
统率着作为邪恶化身的魔族，以暴力与权力不断侵略世界的魔王阿里曼。然而，这位魔王不知为何突然停止了所有的侵略行为！魔界最强的魔王停止侵略的理由……竟然是——魔王家的女儿瞳也太温柔了吧！！虽为魔族之身，瞳的温柔却深不见底。这份温柔之强大，就连凶残的魔族、暴戾的魔物、被奴役的人类，乃至势不两立的天使，都能被治愈得心都化开。女儿这副模样，让魔王担心得不得了，哪还有心思去侵略啊。看到魔王苦恼的模样，近臣贾希决心要将瞳培养成出色的魔族，于是开始对她进行各种试炼。然而贾希尚未察觉，这些试炼反而会让瞳的温柔之心愈发闪耀……而瞳的这份温柔，正在这个毫不温柔的世界里激起阵阵涟漪——
“一直…想和你接触”——王子×竞争者。 本应该争夺女主角的……不知为什么王子瞄准了我…！？ 转生到小说世界的罗尼尔，本来是阻碍故事主角恋爱道路的“碍事角色”，很好地把握了自己的立场，为了不因妨碍而定罪，拼命地避开英雄王子埃里克……没想到王子竟然沉迷于罗尼尔！？ “明明是新手，却很容易有感觉，多么可爱的身体啊……”在拒绝的时候，却被当成了欲拒还迎—— 诶……为什么和小说不一样呢！？
由于委托很少，毛利侦探事务所门可罗雀，小兰不得不精打细算，小五郎也整日靠看自己上节目的录像打发时光。某日，小五郎收到一件神秘包裹，却对柯南和小兰隐瞒再三。正在这时，一通神秘电话打入事务所，柯南接听，却发现竟是一通搭错线的恐吓电话。小五郎对此全不上心，而柯南对此念念不忘。对方的声音与服部平次颇为相似，于是他请来服部一同调查。他们按照与事务所相近的电话号码逐一打去，终于发现一个姓岩爪的宝石商人和恐吓电话有关。他们赶到岩爪的公寓，得知警方已经先行到达，不久更知晓怪盗基德似乎也与此案有关。真相究竟如何？
曾经，世界面临着被称为「邪龙」的邪恶存在所毁灭。 然而，一个勇者打败了邪龙，拯救了世界。 此后，已经过了将近200年的时间。 在众多的迷宫都市之一的马萨特，住着一个被称为「无能」的男人。 他叫劳斯特，职业是治愈师。 由于他的无能，劳斯特受到其他冒险者的蔑视、利用和抛弃。 他的日子就是这样日复一日的重复着。 某一天，一个少女出现在了劳斯特的面前。 她叫纳尔赛娜，职业是武道家。 纳尔赛娜对刚刚被队伍驱逐的劳斯特说： “哥哥，你愿意和我组队吗？” 如今，劳斯特和纳尔赛娜，两个人的冒险开始了。
本片由四个短片组成。《九十九》健硕的手艺人在山中突逢暴雨，他仓促间在一座祠堂歇脚，谁知里面别有洞天。被人用烂丢弃的雨伞和绸缎将他团团围住，手艺人不为所惧，拿出随身携带的针头线脑缝补这些充满悲怨的旧物。《火要镇》商人之女若（早见沙织 配音）和邻家男孩年松吉（森田成一 配音）青梅竹马，两情相悦 。但是家境悬殊的二人终究有缘无分。即将出嫁的小若不慎引燃烛火，可在那一刻她却突然停止灭火呼救的念头。 《GAMBO》某座山村饱受巨大的赤鬼困扰，村民不得不将少女奉献出去以求苟存。村中最后一个女孩（田村睦心 配音）在森林里遇见可怕的白熊，她诉说了心中的苦衷，而白熊却像听懂了一般杀向赤鬼的老巢。《别了武器》一伙全副武装的战士来到早已成为废墟的都市，他们高度戒备，全力备战，只为围捕一辆无人驾驶的战车。
阿凡无意间干扰了时光特警队出任务，现在得和队员莉姆一起回到过去，穿梭各个时空拯救无辜性命，也亲眼见证历史往前推进。
“我想找到我的喜欢” 涩谷是一个充满个体同一性的城市。 在夜晚的涩谷，什么都做不到的少女漂浮着，而她以一次特别的相遇为契机开始改变。
22 岁的软件开发者萨姆·杨自幼便是狂热的游戏爱好者。学生时代全身心投入游戏开发，终于推出了酝酿已久的冒险解谜游戏《Luminate》！然而，当超人气游戏主播马歇尔·劳给出恶评后，她作为游戏开发者的前途骤然黯淡。更意外的是——马歇尔竟搬到了她隔壁！ 随着与马歇尔的相遇，萨姆与公司上司查尔斯·琼斯、发小兼常去咖啡馆的员工林肯·哈德森等人的关系也逐渐发生变化。在父母过度保护下长大、恋爱经验为零的萨姆，面对与男性突如其来的亲密接触不知所措，却也开始慢慢打破心防。 这场以人生为赌注的终极挑战——萨姆能否成功通关！？
