神奇阿呦第二部全集故事讲述的是在神奇阿呦第一季最后一集中阿呦为了给小米去掉颜料，前往别的星球，机器流星人利用阿呦的善心逃脱，却引来了一个真正的流星人阿巴。阿呦把流星人阿巴带回小米家，但小米嫌它吵，阿巴就跑出去了。阿巴觉得实现别人的愿望很难，很伤心，想要回宇宙。
在一个月朗星稀的夜晚，美雪（易蜜儿 饰）、美琪（周利书 饰）、石小龙（沈策 饰）等好朋友在观星露营时，意外目击一枚硕大的陨石。连同陨石一同出现的，还有神秘的魔法师和受伤的美丽小鸟。美雪、美琪将小鸟带回家，并为之取名小星。未过多久，两个神秘怪异之人盯上了凌家姐妹。而各种危机和诡异事件也交替发生在姐妹俩的身上。正在此危急时刻，小蓝（廖景萱 饰）和游乐王子（袁奇峰 饰）及时赶到，化解了美雪她们的危机。原来名叫哈莱星的星球发生异变，脱离轨道的哈莱星正向地球撞来。危险渐次逼近，正义的小魔仙最终能否拯救世界…… 本片为同名电视剧的电影版。
话说玉皇大帝安排唐僧师徒整理天庭档案后。搞得整个天庭鸡飞狗跳，玉帝被众神仙堵在了凌霄宝殿门口。众仙情绪激动，以不成功便成仁的誓死精神逼迫玉帝撤职查办师徒四人，还要登报道歉，摆酒赔钱。虽然玉帝也早就后悔死了，但毕竟人家是如来佛祖的关系户，而且天庭档案管理的工作又是自己安排的，现在开除他们好像也有点自抽耳光，思量再三，决定祸水要流外人田，让这几个狗血的家伙到自己的远房表哥宙斯和堂兄奥丁那里去。
故事讲述了三个女孩在动物伙伴们的帮助下拥有了神奇的动物之力，变身超级英雄抵抗邪恶势力，守护青竹城的和平与正义。
